Son incontrovertibles las palabras de Fuu cuando, en el episodio 14, dice: "Rescata a una princesa y salva un mundo, la historia es bastante común, pero es entretenida y emociónante". Es cierto, la historia ya ha sido explotada muchas veces – con distintas formas y resultados – a través de los años.

Sin embargo, y gracias al estilo particular de las CLAMP, la historia clásica se transforma, adquiere nuevas dimensiones, toma sorprendentes matices, y surgen insospechados giros argumentales. Gracias a esto, MKR no se pierde en los clichés y estereotipos tradicionales, y adquiere personalidad y unicidad.

Elementos claves en MKR son: el papel principal se reparte entre tres chicas (a diferencia de las historias tradicionales con un sólo héroe), la impredictibilidad de la narración, el uso de espadas y poderes mágicos, acción, humor negro, romance, mensajes serios y profundos y un verdadero desarrollo de los personajes. Todo esto debidamente dosificado, de modo que en ningún momento la serie se vuelve repetitiva ni saturadora.

Todo comienza en el místico mundo de Céfiro: la Princesa Esmeralda, Pilar del Planeta, ha sido raptada por el hechicero Zagato. Sin la princesa, cuyas oraciones mantienen la estabilidad de Céfiro, el planeta empieza a derrumbarse. Atendiendo a una antigua profecía, Esmeralda debe convocar a las Legendarias Guerreras Mágicas, de quienes se espera que eviten la destrucción de Céfiro.

Conocemos a nuestras guerreas Mágicas en el mirador de Torre de Tokyo. La causalidad hace que tres chicas: Lucy, Marina y Anaís (Hikaru, Umi, y Fuu, respectivamente), se encuentren juntas en el momento que una luz intensa, generada por el llamado de Esmeralda, deslumbra el mirador y transporta a las tres jóvenes al mundo Céfiro. Allí son recibidas por Guru Clef, el más grande hechicero del mundo místico, quien les da sus poderes mágicos y les advierte:

Para cumplir su misión, Lucy, Marina y Anaís deben pasar por todo un proceso antes de completar su formación como Guerreras Mágicas. La artesana Presea crea, justo antes de morir, las armas que las chicas deberán desarrollar para poder enfrentarse a los aliados de Zagato, quienes intentarán evitar que las Guerreras Mágicas despierten a los Genios (God-Machines).

En este proceso las jóvenes van adquiriendo confianza en sí mismas y aprenden a conocer la fuerza de sus corazones, desarrollándose cada vez más. Tras despertar a los Genios, con los cuales deberán combatir contra aquello que causa la inestabilidad de Céfiro, las Guerreras se encaminan a su objetivo final: vencer a Zagato.

La batalla final no se presenta nada fácil, y es sólo con su gran esfuerzo y los poderes combinados de las chicas con la fuerza de los genios que logran derrotar al malvado Zagato.

Pero aun hay algo más: para realmente salvar Céfiro de la destrucción, Las guerreras Mágicas deben... Bueno, todos sabemos lo que ocurre. El capitulo final de esta primera parte es uno de los más inquietantes y dolorosos que puedan recordarse. Es en este punto donde la historia rompe definitivamente con todo el precedente clásico pues, al final de cuentas, los "malos" realmente no lo eran y los "buenos"...

En fin, todo al interior de la historia es relativo y depende del punto de vista y el sistema de valores particulares a cada personaje.

Después de cumplir su misión, Lucy, Marina, Y Anaís regresan a la Torre de Tokyo. Estuvieron ausentes de nuestro mundo por tan solo un instante, pero el dolor sufrido por ellas en Céfiro no sería tan pasajero...

"Céfiro se esta desgastando. Muriendo es una mejor descripción". Tristes pero verídicas palabras que Guru Clef dice a Lucy, Marina y Anaís cuando misteriosamente son transportadas de nuevo al mundo Céfiro. Sin su Pilar, el planeta ha sufrido una transformación radical: los mares han desaparecido, ya no hay más verde en sus suelos, y el alguna vez azul y hermoso cielo no es más que un manto oscuro y sin vida... la destrucción avanza a pasos acelerados. Es por eso que los habitantes de Céfiro se han refugiado en un castillo que han construido para protegerse. Para empeorar las cosas, tres planetas enemigos están buscando tomar el lugar del Pilar.

Debido al cambio de las circunstancias, los personajes tanto principales como secundarios toman nuevos aires y esta vez se hace más evidente la fuerte relación entre ellos. Tampoco faltan los bien logrados viajes al interior de los personajes que nos permiten conocer y comprender los que ocurre en sus corazones. En cuento a recursos narrativos, el acertado uso de flashbacks funciona al momento de completar la coherencia de la história.

En esta ocasión la línea argumental se complica, fraccionandose en el desarrollo paralelo de tres situaciones principales diferentes: la relación de cada Guerrera Mágica con los representantes de los tres planetas invasores: La princesa Aska de Pharem, las hermanas Tata y Tatra de Cizeta (pronunciar "Chizeta"), y Águila de Autozam. Cada invasor tiene sus propios motivos para querer tomar posesión del sistema del Pilar de Céfiro, y aunque nuestras heroínas intentan razonar con ellos, las batallas son inevitables.

Por otro lado, las CLAMP introducen de nuevo sorpresillas que serán definitivas en el desarrollo de la serie: un nuevo personaje, la misteriosa Luz (Nova) se encarga de hacerle la vida imposible a Lucy en su regreso a Céfiro. ¿La razón? Luz es la materialización del dolor que Lucy experimentó al eliminar a la Princesa Esmeralda; ahora, ese lado oscuro de su corazón se convertirá en un peligro para ella misma y quienes la rodean. La única manera de vencer a Luz es que Lucy aprenda a aceptar la realidad de lo que siente su corazón, y aceptarse a sí misma.

Otra sorpresa es la "resurrección" de Presea. Que no es más que una mentira blanca urdida para evitarle más tristeza a las chicas. La "Presea" de esta ocasión es la desconocida hermana gemela menor de la artesana original.

Después de vencer a los enemigos y lograr convertirlos en aliados, las Guerreras Mágicas enfrentan al ultimo y más fuerte obstáculo: Debonair, un espíritu maligno que se alimenta del temor de los corazones de los habitantes de Céfiro, y cuyo objetivo es destruir Céfiro y convertirlo en un "lugar donde la vida es una utopía".

La situación al final no puede ser más tensa: el símbolo del nuevo Pilar está a punto de revelarse, y todo indica que será Águila o Lucy; el poder de Debonair es muy fuerte y amenaza con ganar la batalla; al interior del inestable castillo todo es incertidumbre y temor; Alanis ha entregado su vida por salvar la de los demás; y Guru Clef está usando todo el poder que le queda protegiendo el refugio.

Todo se resuelve como tienen que suceder, como el destino había dictado. Debonair es vencida gracias al valor demostrado por los corazones de los cefirianos, y el planeta puede estar en paz de nuevo. Lucy renuncia al honor de ser el nuevo pilar, y la reconstrucción de Céfiro empieza. La historia termina con la realización del deseo de Latís: "Un Céfiro en donde las flores crezcan sin la necesidad de un Pilar", por fin, de regreso a Tokyo, ya no hay dolor ni resentimientos.